Den afgrøde der kommer efter en hovedafgrøde. Funktionen af efterafgrøden kan fx være jordløsning, opsamling af næringsstoffer, mobilisering af fosfor i jorden, højere biodiversitet, skabe levested for insekter og fugle samt kulstoflagring. De forskellige arter af efterafgrøder har forskellige virkemekanismer. 

I Commodicarbon programmet skal man indsætte efterafgrøden forud for hovedafgrøden. Står man i Markstrategifanen, skal man altså indtaste hvordan efterafgrøde praksis forud for den kommende  hovedafgrøde.